Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB2Q9Y5G2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHGB2Q9Y5G2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB2Q9Y5G2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB2Q9Y5G2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGB2Q9Y5G2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms