Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX24Q9Y343 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX24Q9Y343 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms