Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRG3Q9Y2Y8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRG3Q9Y2Y8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRG3Q9Y2Y8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG3Q9Y2Y8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms