Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4AQ9UMR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLEC4AQ9UMR7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms