Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS11EQ9UL52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS11EQ9UL52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS11EQ9UL52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS11EQ9UL52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms