Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PILRAQ9UKJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PILRAQ9UKJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PILRAQ9UKJ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PILRAQ9UKJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PILRAQ9UKJ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PILRAQ9UKJ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PILRAQ9UKJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PILRAQ9UKJ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms