Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NPC1L1Q9UHC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPC1L1Q9UHC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NPC1L1Q9UHC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPC1L1Q9UHC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms