Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NINJ2Q9NZG7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINJ2Q9NZG7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINJ2Q9NZG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NINJ2Q9NZG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms