Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECAP2Q9NVZ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECAP2Q9NVZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms