Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC13Q9NSE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCC13Q9NSE7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC13Q9NSE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC13Q9NSE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC13Q9NSE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC13Q9NSE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms