Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD93Q9NPY3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD93Q9NPY3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD93Q9NPY3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD93Q9NPY3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms