Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARS2Q9NP81 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARS2Q9NP81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARS2Q9NP81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARS2Q9NP81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms