Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM8AQ9HCN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM8AQ9HCN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM8AQ9HCN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM8AQ9HCN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM8AQ9HCN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms