Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF2Q9BZW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF2Q9BZW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM6SF2Q9BZW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM6SF2Q9BZW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms