Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATA5Q9BWX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA5Q9BWX5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA5Q9BWX5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATA5Q9BWX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA5Q9BWX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms