Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSRP1Q9BUV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSRP1Q9BUV0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSRP1Q9BUV0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms