Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRG3Q99928 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRG3Q99928 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRG3Q99928 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRG3Q99928 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms