Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRR1Q96L50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRR1Q96L50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRR1Q96L50 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRR1Q96L50 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms