Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM8Q96KF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM8Q96KF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM8Q96KF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms