Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIC2Q96JB3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIC2Q96JB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIC2Q96JB3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIC2Q96JB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIC2Q96JB3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms