Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC12Q96J65 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC12Q96J65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC12Q96J65 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms