Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1AQ96BI3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APH1AQ96BI3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms