Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL26A1Q96A83 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL26A1Q96A83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL26A1Q96A83 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms