Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCSTNQ92542 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCSTNQ92542 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCSTNQ92542 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms