Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DTX3LQ8TDB6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DTX3LQ8TDB6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DTX3LQ8TDB6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DTX3LQ8TDB6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms