Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL3Q8TAT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL3Q8TAT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL3Q8TAT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms