Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MFSD2AQ8NA29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD2AQ8NA29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD2AQ8NA29 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms