Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTL3Q8N8U3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTL3Q8N8U3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RTL3Q8N8U3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTL3Q8N8U3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTL3Q8N8U3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms