Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00612Q8N6U2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00612Q8N6U2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms