Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM73Q86UV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM73Q86UV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms