Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO6A1Q86UG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO6A1Q86UG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO6A1Q86UG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms