Protein–RNA interactions for Protein: Q86TS9

MRPL52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL52Q86TS9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL52Q86TS9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRPL52Q86TS9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL52Q86TS9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL52Q86TS9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms