Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC141Q6ZP82 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC141Q6ZP82 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CCDC141Q6ZP82 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms