Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UQCC3Q6UW78 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UQCC3Q6UW78 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UQCC3Q6UW78 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UQCC3Q6UW78 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UQCC3Q6UW78 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms