Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOA5Q6Q788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOA5Q6Q788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOA5Q6Q788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOA5Q6Q788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APOA5Q6Q788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms