Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AAGABQ6PD74 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AAGABQ6PD74 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AAGABQ6PD74 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms