Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO42Q6P3S6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO42Q6P3S6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO42Q6P3S6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms