Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARA3Q6AZY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA3Q6AZY7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA3Q6AZY7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms