Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
INTS3Q68E01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
INTS3Q68E01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
INTS3Q68E01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
INTS3Q68E01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
INTS3Q68E01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INTS3Q68E01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INTS3Q68E01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INTS3Q68E01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms