Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DQA1Q5Y7H0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQA1Q5Y7H0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms