Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPANXN1Q5VSR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPANXN1Q5VSR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXN1Q5VSR9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXN1Q5VSR9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms