Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LDLRAP1Q5SW96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAP1Q5SW96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDLRAP1Q5SW96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.3 ms