Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO47Q5MNV8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO47Q5MNV8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO47Q5MNV8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO47Q5MNV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms