Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF542PQ5EBM4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF542PQ5EBM4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF542PQ5EBM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF542PQ5EBM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms