Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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