Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMK4Q16566 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMK4Q16566 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMK4Q16566 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK4Q16566 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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