Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CCDC14-202ENST00000409657 3815 ntTSL 25.46□□□□□ -1.548e-8■■■■■ 59.1
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SF3B4Q15427 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.288e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 UNC13D-203ENST00000585574 658 ntTSL 315.73■□□□□ 0.115e-9■■■■■ 59
SF3B4Q15427 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 518.75■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-214ENST00000533998 581 ntTSL 323.06■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-202ENST00000524546 750 ntTSL 320.86■□□□□ 0.937e-8■■■■■ 58.9
SF3B4Q15427 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 58.9
SF3B4Q15427 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.697e-8■■■■■ 58.9
SF3B4Q15427 FNTA-206ENST00000527153 582 ntTSL 318.61■□□□□ 0.577e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-209ENST00000531266 590 ntTSL 510.57□□□□□ -0.727e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 FNTA-213ENST00000533559 429 ntTSL 37□□□□□ -1.297e-8■■■■■ 58.9
SF3B4Q15427 FNTA-210ENST00000533336 874 ntTSL 36.36□□□□□ -1.397e-8■■■■■ 58.9
SF3B4Q15427 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.57e-8■■■■■ 58.9
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SF3B4Q15427 SFSWAP-202ENST00000535202 567 ntTSL 27.77□□□□□ -1.173e-21■■■■■ 58.8
SF3B4Q15427 HGS-206ENST00000571647 2401 nt15.17■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 58.8
SF3B4Q15427 TRMT2A-208ENST00000459644 582 ntTSL 313.25□□□□□ -0.294e-10■■■■■ 58.8
SF3B4Q15427 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 47.55□□□□□ -1.29e-28■■■■■ 58.7
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SF3B4Q15427 NPLOC4-210ENST00000572824 559 ntTSL 48.23□□□□□ -1.094e-10■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 NPLOC4-211ENST00000573212 564 ntTSL 47.4□□□□□ -1.224e-10■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 PEG3-207ENST00000599534 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.316e-22■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 PEG3-210ENST00000600833 1558 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.076e-22■■■■■ 58.7
SF3B4Q15427 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-204ENST00000477639 1950 ntTSL 219.06■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 58.6
SF3B4Q15427 TMED4-202ENST00000444131 545 ntTSL 417.17■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 58.6
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SF3B4Q15427 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-24■■■■■ 58.5
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SF3B4Q15427 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.333e-24■■■■■ 58.5
SF3B4Q15427 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.343e-24■■■■■ 58.5
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SF3B4Q15427 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.284e-11■■■■■ 58.5
SF3B4Q15427 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.364e-11■■■■■ 58.5
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SF3B4Q15427 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 57.9
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SF3B4Q15427 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 TXNDC5-205ENST00000475802 582 ntTSL 210.67□□□□□ -0.76e-14■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 TXNDC5-202ENST00000460138 2704 ntTSL 210.35□□□□□ -0.756e-14■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 HDAC3-214ENST00000495485 797 ntTSL 39.08□□□□□ -0.964e-12■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 HDAC3-206ENST00000471968 529 ntTSL 36.1□□□□□ -1.434e-12■■■■■ 57.7
SF3B4Q15427 SAT1-207ENST00000474223 1033 ntTSL 25.42□□□□□ -1.549e-9■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 SAT1-205ENST00000462639 826 ntTSL 23.78□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 TM9SF3-202ENST00000443638 868 ntTSL 34.63□□□□□ -1.675e-13■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 TM9SF3-203ENST00000464654 658 ntTSL 53.63□□□□□ -1.835e-13■■■■■ 57.6
SF3B4Q15427 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-210ENST00000530058 571 ntTSL 417.9■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-212ENST00000530655 786 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-209ENST00000528683 721 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-204ENST00000490867 840 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-202ENST00000393711 608 ntTSL 513.38□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 57.5
SF3B4Q15427 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 57.5
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