RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494588.2

DUSP13-211, Transcript of dual specificity phosphatase 13, humanhuman

TSL 2

Gene DUSP13, Length 1,411 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13-211ENST00000494588 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.86■■■■□ 3.33
DUSP13-211ENST00000494588 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.66■■■□□ 2.66
DUSP13-211ENST00000494588 ABCC9O60706 1549 aa30.51■■■□□ 2.47
DUSP13-211ENST00000494588 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
DUSP13-211ENST00000494588 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.79■■■□□ 2.36
DUSP13-211ENST00000494588 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.69■■■□□ 2.34
DUSP13-211ENST00000494588 NACADO15069 1562 aa29.65■■■□□ 2.34
DUSP13-211ENST00000494588 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.62■■■□□ 2.33
DUSP13-211ENST00000494588 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.57■■■□□ 2.32
DUSP13-211ENST00000494588 SCRIBQ14160 1630 aa28.97■■■□□ 2.23
DUSP13-211ENST00000494588 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.83■■■□□ 2.21
DUSP13-211ENST00000494588 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.71■■■□□ 2.19
DUSP13-211ENST00000494588 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.6■■■□□ 2.17
DUSP13-211ENST00000494588 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
DUSP13-211ENST00000494588 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.87■■■□□ 2.05
DUSP13-211ENST00000494588 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
DUSP13-211ENST00000494588 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
DUSP13-211ENST00000494588 SMARCA4P51532 1647 aa27.73■■■□□ 2.03
DUSP13-211ENST00000494588 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.65■■■□□ 2.02
DUSP13-211ENST00000494588 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.59■■■□□ 2.01
DUSP13-211ENST00000494588 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
DUSP13-211ENST00000494588 SMARCA2P51531 1590 aa27.45■■□□□ 1.99
DUSP13-211ENST00000494588 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.44■■□□□ 1.98
DUSP13-211ENST00000494588 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.43■■□□□ 1.98
DUSP13-211ENST00000494588 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.43■■□□□ 1.98
DUSP13-211ENST00000494588 WIZO95785 1651 aa27.38■■□□□ 1.97
DUSP13-211ENST00000494588 NCAPD3P42695 1498 aa27.32■■□□□ 1.96
DUSP13-211ENST00000494588 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
DUSP13-211ENST00000494588 HMGXB3Q12766 1538 aa27.27■■□□□ 1.96
DUSP13-211ENST00000494588 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
DUSP13-211ENST00000494588 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
DUSP13-211ENST00000494588 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.8■■□□□ 1.88
DUSP13-211ENST00000494588 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.57■■□□□ 1.84
DUSP13-211ENST00000494588 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.55■■□□□ 1.84
DUSP13-211ENST00000494588 NESP48681 1621 aa26.53■■□□□ 1.84
DUSP13-211ENST00000494588 CFTRP13569 1480 aa26.52■■□□□ 1.84
DUSP13-211ENST00000494588 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.36■■□□□ 1.81
DUSP13-211ENST00000494588 PRDM2Q13029 1718 aa26.35■■□□□ 1.81
DUSP13-211ENST00000494588 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.3■■□□□ 1.8
DUSP13-211ENST00000494588 ERCC6Q03468 1493 aa26.29■■□□□ 1.8
DUSP13-211ENST00000494588 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.23■■□□□ 1.79
DUSP13-211ENST00000494588 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.23■■□□□ 1.79
DUSP13-211ENST00000494588 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.07■■□□□ 1.76
DUSP13-211ENST00000494588 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
DUSP13-211ENST00000494588 ABCC8Q09428 1581 aa26.01■■□□□ 1.75
DUSP13-211ENST00000494588 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
DUSP13-211ENST00000494588 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
DUSP13-211ENST00000494588 WDR62O43379 1518 aa25.96■■□□□ 1.75
DUSP13-211ENST00000494588 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.95■■□□□ 1.75
DUSP13-211ENST00000494588 TOPBP1Q92547 1522 aa25.93■■□□□ 1.74
DUSP13-211ENST00000494588 CUX1P39880 1505 aa25.91■■□□□ 1.74
DUSP13-211ENST00000494588 SYNJ1O43426 1573 aa25.86■■□□□ 1.73
DUSP13-211ENST00000494588 TOP2BQ02880 1626 aa25.83■■□□□ 1.73
DUSP13-211ENST00000494588 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.83■■□□□ 1.73
DUSP13-211ENST00000494588 CUX2O14529 1486 aa25.79■■□□□ 1.72
DUSP13-211ENST00000494588 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.77■■□□□ 1.72
DUSP13-211ENST00000494588 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
DUSP13-211ENST00000494588 TRIM41Q8WV44 630 aa25.71■■□□□ 1.71
DUSP13-211ENST00000494588 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.71■■□□□ 1.71
DUSP13-211ENST00000494588 IFT140Q96RY7 1462 aa25.65■■□□□ 1.7
DUSP13-211ENST00000494588 SOGA1O94964 1423 aa25.64■■□□□ 1.7
DUSP13-211ENST00000494588 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.62■■□□□ 1.69
DUSP13-211ENST00000494588 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
DUSP13-211ENST00000494588 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.53■■□□□ 1.68
DUSP13-211ENST00000494588 WDR97A6NE52 1622 aa25.5■■□□□ 1.67
DUSP13-211ENST00000494588 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
DUSP13-211ENST00000494588 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
DUSP13-211ENST00000494588 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
DUSP13-211ENST00000494588 KIF27Q86VH2 1401 aa25.39■■□□□ 1.66
DUSP13-211ENST00000494588 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.39■■□□□ 1.65
DUSP13-211ENST00000494588 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.655e-6■■□□□ 14.3
DUSP13-211ENST00000494588 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.36■■□□□ 1.65
DUSP13-211ENST00000494588 GRIN2BQ13224 1484 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP13-211ENST00000494588 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.28■■□□□ 1.64
DUSP13-211ENST00000494588 PBRM1Q86U86 1689 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP13-211ENST00000494588 EEA1Q15075 1411 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP13-211ENST00000494588 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP13-211ENST00000494588 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.21■■□□□ 1.63
DUSP13-211ENST00000494588 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
DUSP13-211ENST00000494588 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
DUSP13-211ENST00000494588 IGF1RP08069 1367 aa25.17■■□□□ 1.62
DUSP13-211ENST00000494588 ADAMTS12P58397 1594 aa25.13■■□□□ 1.61
DUSP13-211ENST00000494588 CUL7Q14999 1698 aa25.12■■□□□ 1.61
DUSP13-211ENST00000494588 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.12■■□□□ 1.61
DUSP13-211ENST00000494588 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.1■■□□□ 1.61
DUSP13-211ENST00000494588 SYNJ2O15056 1496 aa25.07■■□□□ 1.6
DUSP13-211ENST00000494588 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.06■■□□□ 1.6
DUSP13-211ENST00000494588 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.03■■□□□ 1.6
DUSP13-211ENST00000494588 FBLN2P98095 1184 aa25.02■■□□□ 1.6
DUSP13-211ENST00000494588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
DUSP13-211ENST00000494588 PRXQ9BXM0 1461 aa25■■□□□ 1.59
DUSP13-211ENST00000494588 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.99■■□□□ 1.59
DUSP13-211ENST00000494588 GRIN2AQ12879 1464 aa24.97■■□□□ 1.59
DUSP13-211ENST00000494588 CHD1O14646 1710 aa24.96■■□□□ 1.59
DUSP13-211ENST00000494588 KIF21BO75037 1637 aa24.94■■□□□ 1.58
DUSP13-211ENST00000494588 GOLGA3Q08378 1498 aa24.87■■□□□ 1.57
DUSP13-211ENST00000494588 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.84■■□□□ 1.57
DUSP13-211ENST00000494588 NUP160Q12769 1436 aa24.82■■□□□ 1.56
DUSP13-211ENST00000494588 CEP170Q5SW79 1584 aa24.81■■□□□ 1.56
DUSP13-211ENST00000494588 OSCARQ8IYS5 282 aa24.78■■□□□ 1.56
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