RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491677.6

DUSP13-210, Transcript of dual specificity phosphatase 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP13, Length 1,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13-210ENST00000491677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.99■■■■□ 3.51
DUSP13-210ENST00000491677 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.34■■■□□ 2.77
DUSP13-210ENST00000491677 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
DUSP13-210ENST00000491677 ABCC9O60706 1549 aa30.77■■■□□ 2.52
DUSP13-210ENST00000491677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.72■■■□□ 2.51
DUSP13-210ENST00000491677 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.52■■■□□ 2.48
DUSP13-210ENST00000491677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.24■■■□□ 2.43
DUSP13-210ENST00000491677 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.19■■■□□ 2.42
DUSP13-210ENST00000491677 NACADO15069 1562 aa30.13■■■□□ 2.41
DUSP13-210ENST00000491677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.95■■■□□ 2.38
DUSP13-210ENST00000491677 SCRIBQ14160 1630 aa29.83■■■□□ 2.37
DUSP13-210ENST00000491677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.38■■■□□ 2.29
DUSP13-210ENST00000491677 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.01■■■□□ 2.23
DUSP13-210ENST00000491677 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
DUSP13-210ENST00000491677 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
DUSP13-210ENST00000491677 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.79■■■□□ 2.2
DUSP13-210ENST00000491677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
DUSP13-210ENST00000491677 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.61■■■□□ 2.17
DUSP13-210ENST00000491677 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
DUSP13-210ENST00000491677 SMARCA4P51532 1647 aa28.51■■■□□ 2.15
DUSP13-210ENST00000491677 WIZO95785 1651 aa28.42■■■□□ 2.14
DUSP13-210ENST00000491677 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
DUSP13-210ENST00000491677 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.09■■■□□ 2.09
DUSP13-210ENST00000491677 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
DUSP13-210ENST00000491677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.03■■■□□ 2.08
DUSP13-210ENST00000491677 SMARCA2P51531 1590 aa28.03■■■□□ 2.08
DUSP13-210ENST00000491677 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
DUSP13-210ENST00000491677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.82■■■□□ 2.04
DUSP13-210ENST00000491677 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.77■■■□□ 2.04
DUSP13-210ENST00000491677 HMGXB3Q12766 1538 aa27.77■■■□□ 2.04
DUSP13-210ENST00000491677 NCAPD3P42695 1498 aa27.77■■■□□ 2.04
DUSP13-210ENST00000491677 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.59■■■□□ 2.01
DUSP13-210ENST00000491677 TRIM41Q8WV44 630 aa27.22■■□□□ 1.95
DUSP13-210ENST00000491677 ABCC8Q09428 1581 aa27.22■■□□□ 1.95
DUSP13-210ENST00000491677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.17■■□□□ 1.94
DUSP13-210ENST00000491677 CFTRP13569 1480 aa27.14■■□□□ 1.94
DUSP13-210ENST00000491677 PRDM2Q13029 1718 aa27.09■■□□□ 1.93
DUSP13-210ENST00000491677 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.08■■□□□ 1.93
DUSP13-210ENST00000491677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
DUSP13-210ENST00000491677 NESP48681 1621 aa26.96■■□□□ 1.91
DUSP13-210ENST00000491677 SYNJ1O43426 1573 aa26.93■■□□□ 1.9
DUSP13-210ENST00000491677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.91■■□□□ 1.9
DUSP13-210ENST00000491677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.84■■□□□ 1.89
DUSP13-210ENST00000491677 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
DUSP13-210ENST00000491677 TOP2BQ02880 1626 aa26.8■■□□□ 1.88
DUSP13-210ENST00000491677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.78■■□□□ 1.88
DUSP13-210ENST00000491677 CUX1P39880 1505 aa26.77■■□□□ 1.88
DUSP13-210ENST00000491677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
DUSP13-210ENST00000491677 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.69■■□□□ 1.86
DUSP13-210ENST00000491677 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.67■■□□□ 1.86
DUSP13-210ENST00000491677 SOGA1O94964 1423 aa26.63■■□□□ 1.85
DUSP13-210ENST00000491677 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.58■■□□□ 1.85
DUSP13-210ENST00000491677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.57■■□□□ 1.84
DUSP13-210ENST00000491677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
DUSP13-210ENST00000491677 TOPBP1Q92547 1522 aa26.52■■□□□ 1.84
DUSP13-210ENST00000491677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.51■■□□□ 1.83
DUSP13-210ENST00000491677 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.51■■□□□ 1.83
DUSP13-210ENST00000491677 EEA1Q15075 1411 aa26.5■■□□□ 1.83
DUSP13-210ENST00000491677 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
DUSP13-210ENST00000491677 ERCC6Q03468 1493 aa26.42■■□□□ 1.82
DUSP13-210ENST00000491677 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.39■■□□□ 1.82
DUSP13-210ENST00000491677 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.39■■□□□ 1.81
DUSP13-210ENST00000491677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
DUSP13-210ENST00000491677 CUX2O14529 1486 aa26.33■■□□□ 1.81
DUSP13-210ENST00000491677 KIF27Q86VH2 1401 aa26.32■■□□□ 1.8
DUSP13-210ENST00000491677 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.32■■□□□ 1.8
DUSP13-210ENST00000491677 WDR62O43379 1518 aa26.24■■□□□ 1.79
DUSP13-210ENST00000491677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.22■■□□□ 1.79
DUSP13-210ENST00000491677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
DUSP13-210ENST00000491677 KIF21BO75037 1637 aa26.22■■□□□ 1.79
DUSP13-210ENST00000491677 WDR97A6NE52 1622 aa26.2■■□□□ 1.78
DUSP13-210ENST00000491677 GOLGA3Q08378 1498 aa26.2■■□□□ 1.78
DUSP13-210ENST00000491677 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
DUSP13-210ENST00000491677 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
DUSP13-210ENST00000491677 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.1■■□□□ 1.77
DUSP13-210ENST00000491677 PRXQ9BXM0 1461 aa26.07■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.06■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 IGF1RP08069 1367 aa26.06■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.04■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.03■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 IFT140Q96RY7 1462 aa26.03■■□□□ 1.76
DUSP13-210ENST00000491677 GAPVD1Q14C86 1478 aa26■■□□□ 1.75
DUSP13-210ENST00000491677 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.96■■□□□ 1.75
DUSP13-210ENST00000491677 CEP162Q5TB80 1403 aa25.95■■□□□ 1.74
DUSP13-210ENST00000491677 CUL7Q14999 1698 aa25.94■■□□□ 1.74
DUSP13-210ENST00000491677 PBRM1Q86U86 1689 aa25.94■■□□□ 1.74
DUSP13-210ENST00000491677 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.745e-6■■□□□ 14.3
DUSP13-210ENST00000491677 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
DUSP13-210ENST00000491677 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
DUSP13-210ENST00000491677 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
DUSP13-210ENST00000491677 GRIN2BQ13224 1484 aa25.81■■□□□ 1.72
DUSP13-210ENST00000491677 CLIP1P30622 1438 aa25.77■■□□□ 1.72
DUSP13-210ENST00000491677 ADAMTS12P58397 1594 aa25.75■■□□□ 1.71
DUSP13-210ENST00000491677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.71■■□□□ 1.71
DUSP13-210ENST00000491677 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.7■■□□□ 1.7
DUSP13-210ENST00000491677 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.68■■□□□ 1.7
DUSP13-210ENST00000491677 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
DUSP13-210ENST00000491677 ARAP1Q96P48 1450 aa25.54■■□□□ 1.68
DUSP13-210ENST00000491677 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms