Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SF3B3Q15393 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SF3B3Q15393 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SF3B3Q15393 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SF3B3Q15393 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
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